La OTC es la tercera enzima del CU, cuya actividad solo se expresa en hígado y, en mucha menor proporción, en duodeno. La deficiencia de actividad de OTC interfiere en función del  ciclo de la urea, causando hiperamonemia. Es uno de los defectos más frecuentes y graves, especialmente en el sexo masculino.

A diferencia de lo que ocurre cuando el niño tiene una PKU grave, en la HPA moderada no hace falta tratamiento dietético ya que la concentración de fenilalanina se mantiene dentro de un rango no peligroso para el niño.

Únicamente se debe continuar controlando, tanto clínica- como bioquímicamente para asegurar que la concentración de fenilalanina no se eleva al añadir alimentos muy ricos en proteínas (carne, pescado) a la dieta.